Тие првично биле замислени како дел од алхемијата или прото-науката (пред-наука), која подоцна еволуирала во хемија. Сè до 18 век, гореспоменатите симболи се користеле за означување на одредени елементи и соединенија. Симболите малку се разликуваа во ознаките на алхемичарите, така што оние што ги знаеме до денес се резултат на стандардизацијата на овие ознаки.
Според Парацелзус, овие знаци се познати како првите три:
сол - што ја означува основата на супстанцијата - означена во форма на круг со јасно означен хоризонтален дијаметар,
живата, што значи течна врска помеѓу високото и ниското, е круг со полукруг на врвот и крст на дното,
сулфур - духот на животот - триаголник поврзан со крст.
Следниве се симболите за елементите на земјата, сите во форма на триаголници:
Метали означени со симболи на планети и небесни тела:
Алхемиските симболи исто така вклучуваат:
Ouroboros е змија која ја јаде сопствената опашка; во алхемијата, тој симболизира постојано обновувачки метаболички процес; тоа е близнак на филозофскиот камен.
Хептаграм - значи седум планети познати на алхемичарите во античко време; нивните симболи се прикажани погоре.